MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 plasmid E

Total Repeats: 649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009008	GCC	2	6	199	204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654694
2	NC_009008	CG	3	6	207	212	0 %	0 %	50 %	50 %	125654694
3	NC_009008	CCGC	2	8	254	261	0 %	0 %	25 %	75 %	125654694
4	NC_009008	CTG	2	6	262	267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654694
5	NC_009008	CGCC	2	8	273	280	0 %	0 %	25 %	75 %	125654694
6	NC_009008	CGT	2	6	291	296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654694
7	NC_009008	ACG	2	6	323	328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654694
8	NC_009008	GC	3	6	335	340	0 %	0 %	50 %	50 %	125654694
9	NC_009008	GCC	2	6	386	391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654694
10	NC_009008	GCT	2	6	426	431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654694
11	NC_009008	CGG	2	6	440	445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654694
12	NC_009008	GCG	2	6	480	485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654694
13	NC_009008	TGC	2	6	497	502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654694
14	NC_009008	GGTCG	2	10	504	513	0 %	20 %	60 %	20 %	125654694
15	NC_009008	GAC	2	6	528	533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654694
16	NC_009008	GCCGC	2	10	538	547	0 %	0 %	40 %	60 %	125654694
17	NC_009008	GCT	2	6	825	830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654695
18	NC_009008	CGC	2	6	893	898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654695
19	NC_009008	GGC	2	6	930	935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654695
20	NC_009008	GCT	2	6	978	983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654695
21	NC_009008	GCC	2	6	1004	1009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654695
22	NC_009008	GCT	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654695
23	NC_009008	GC	3	6	1106	1111	0 %	0 %	50 %	50 %	125654695
24	NC_009008	GTG	2	6	1126	1131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654695
25	NC_009008	TGG	2	6	1163	1168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654695
26	NC_009008	GGT	2	6	1257	1262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654695
27	NC_009008	CAC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654695
28	NC_009008	CG	3	6	1295	1300	0 %	0 %	50 %	50 %	125654695
29	NC_009008	GC	3	6	1361	1366	0 %	0 %	50 %	50 %	125654695
30	NC_009008	CCT	2	6	1437	1442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654695
31	NC_009008	CGCCCG	2	12	1481	1492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654695
32	NC_009008	TGCGC	2	10	1533	1542	0 %	20 %	40 %	40 %	125654695
33	NC_009008	CTGG	2	8	1545	1552	0 %	25 %	50 %	25 %	125654695
34	NC_009008	CCG	2	6	1614	1619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654695
35	NC_009008	C	6	6	1642	1647	0 %	0 %	0 %	100 %	125654695
36	NC_009008	GAGG	2	8	1669	1676	25 %	0 %	75 %	0 %	125654695
37	NC_009008	GCCG	2	8	1698	1705	0 %	0 %	50 %	50 %	125654695
38	NC_009008	TCG	2	6	2132	2137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
39	NC_009008	ATC	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654696
40	NC_009008	CCT	2	6	2213	2218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654696
41	NC_009008	CGT	2	6	2229	2234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
42	NC_009008	GAT	2	6	2262	2267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654696
43	NC_009008	GCC	2	6	2272	2277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
44	NC_009008	CCG	2	6	2288	2293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
45	NC_009008	CTG	2	6	2335	2340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
46	NC_009008	GCC	2	6	2341	2346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
47	NC_009008	TGA	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654696
48	NC_009008	GCC	2	6	2502	2507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
49	NC_009008	GGC	2	6	2526	2531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654696
50	NC_009008	CAT	2	6	2541	2546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654696
51	NC_009008	CGC	2	6	2582	2587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
52	NC_009008	CAT	2	6	2595	2600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654696
53	NC_009008	GC	3	6	2660	2665	0 %	0 %	50 %	50 %	125654696
54	NC_009008	ATC	2	6	2728	2733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654696
55	NC_009008	GGT	2	6	2757	2762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654696
56	NC_009008	TGA	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654696
57	NC_009008	TCG	2	6	2795	2800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
58	NC_009008	CGC	2	6	2862	2867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
59	NC_009008	CGG	2	6	2880	2885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654696
60	NC_009008	GAT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654696
61	NC_009008	CGGG	2	8	2933	2940	0 %	0 %	75 %	25 %	125654696
62	NC_009008	GGC	2	6	2945	2950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654696
63	NC_009008	GGCG	2	8	2964	2971	0 %	0 %	75 %	25 %	125654696
64	NC_009008	CTG	2	6	2977	2982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
65	NC_009008	TCG	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
66	NC_009008	GTC	2	6	3007	3012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
67	NC_009008	TCG	2	6	3035	3040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
68	NC_009008	CAT	2	6	3042	3047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654696
69	NC_009008	GTC	2	6	3078	3083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
70	NC_009008	TCC	3	9	3112	3120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654696
71	NC_009008	GTG	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654696
72	NC_009008	TGC	2	6	3191	3196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
73	NC_009008	TCT	2	6	3206	3211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654696
74	NC_009008	CGC	2	6	3213	3218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
75	NC_009008	GC	4	8	3267	3274	0 %	0 %	50 %	50 %	125654696
76	NC_009008	GCC	2	6	3328	3333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
77	NC_009008	CCG	2	6	3438	3443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654696
78	NC_009008	TCG	2	6	3494	3499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654696
79	NC_009008	TGG	2	6	3591	3596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654697
80	NC_009008	CTG	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654697
81	NC_009008	GCC	2	6	3687	3692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654697
82	NC_009008	GCC	2	6	3698	3703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654697
83	NC_009008	GC	3	6	3723	3728	0 %	0 %	50 %	50 %	125654697
84	NC_009008	CGCAGG	2	12	3798	3809	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	125654697
85	NC_009008	GGCG	2	8	3810	3817	0 %	0 %	75 %	25 %	125654697
86	NC_009008	GCC	2	6	3845	3850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654697
87	NC_009008	TGG	2	6	3933	3938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654697
88	NC_009008	CCT	2	6	4000	4005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654697
89	NC_009008	GC	3	6	4006	4011	0 %	0 %	50 %	50 %	125654697
90	NC_009008	GCCG	2	8	4047	4054	0 %	0 %	50 %	50 %	125654697
91	NC_009008	TGG	2	6	4068	4073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654697
92	NC_009008	CGG	2	6	4081	4086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654697
93	NC_009008	GGC	2	6	4117	4122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654697
94	NC_009008	GCGG	2	8	4163	4170	0 %	0 %	75 %	25 %	125654697
95	NC_009008	GAG	2	6	4172	4177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654697
96	NC_009008	CG	3	6	4181	4186	0 %	0 %	50 %	50 %	125654697
97	NC_009008	GC	3	6	4195	4200	0 %	0 %	50 %	50 %	125654697
98	NC_009008	GCT	2	6	4210	4215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654697
99	NC_009008	GGC	2	6	4228	4233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654697
100	NC_009008	CCT	2	6	4243	4248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654697
101	NC_009008	GC	3	6	4254	4259	0 %	0 %	50 %	50 %	125654697
102	NC_009008	ATC	2	6	4349	4354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125654697
103	NC_009008	ACC	3	9	4361	4369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654697
104	NC_009008	CGC	2	6	4579	4584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654698
105	NC_009008	GAG	2	6	4676	4681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654698
106	NC_009008	TCG	2	6	4723	4728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654698
107	NC_009008	AGG	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125654698
108	NC_009008	CCA	2	6	4765	4770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654698
109	NC_009008	GATCCA	2	12	4778	4789	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	125654698
110	NC_009008	CAG	2	6	4841	4846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654698
111	NC_009008	GCC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654698
112	NC_009008	CAGGA	2	10	4980	4989	40 %	0 %	40 %	20 %	125654698
113	NC_009008	GCA	2	6	5080	5085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654699
114	NC_009008	AAT	2	6	5090	5095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125654699
115	NC_009008	CTT	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654699
116	NC_009008	GCG	2	6	5165	5170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654699
117	NC_009008	AGCC	2	8	5186	5193	25 %	0 %	25 %	50 %	125654699
118	NC_009008	CTG	2	6	5228	5233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654699
119	NC_009008	GC	4	8	5281	5288	0 %	0 %	50 %	50 %	125654699
120	NC_009008	CGC	2	6	5301	5306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654699
121	NC_009008	GCCGC	2	10	5363	5372	0 %	0 %	40 %	60 %	125654699
122	NC_009008	TGG	2	6	5466	5471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125654699
123	NC_009008	AGA	2	6	5478	5483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125654699
124	NC_009008	GAT	2	6	5494	5499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654699
125	NC_009008	GCC	2	6	5554	5559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654699
126	NC_009008	GACC	2	8	5584	5591	25 %	0 %	25 %	50 %	125654699
127	NC_009008	TA	3	6	5594	5599	50 %	50 %	0 %	0 %	125654699
128	NC_009008	CTG	2	6	5603	5608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654699
129	NC_009008	GTCCG	2	10	5627	5636	0 %	20 %	40 %	40 %	125654699
130	NC_009008	CAC	2	6	5701	5706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654699
131	NC_009008	GCCGT	2	10	5826	5835	0 %	20 %	40 %	40 %	125654699
132	NC_009008	C	6	6	5870	5875	0 %	0 %	0 %	100 %	125654699
133	NC_009008	CGC	2	6	5918	5923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654699
134	NC_009008	CCG	2	6	5991	5996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654699
135	NC_009008	CGA	2	6	6426	6431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654700
136	NC_009008	TCGGC	2	10	6447	6456	0 %	20 %	40 %	40 %	125654700
137	NC_009008	CGC	2	6	6485	6490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654700
138	NC_009008	GC	3	6	6511	6516	0 %	0 %	50 %	50 %	125654700
139	NC_009008	GGC	2	6	6519	6524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654700
140	NC_009008	CT	3	6	6661	6666	0 %	50 %	0 %	50 %	125654700
141	NC_009008	CG	3	6	6674	6679	0 %	0 %	50 %	50 %	125654700
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143	NC_009008	GGGCG	2	10	6759	6768	0 %	0 %	80 %	20 %	125654700
144	NC_009008	CGGA	2	8	6819	6826	25 %	0 %	50 %	25 %	125654700
145	NC_009008	CG	3	6	6884	6889	0 %	0 %	50 %	50 %	125654701
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147	NC_009008	GCGACC	2	12	6929	6940	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	125654701
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149	NC_009008	GGCG	2	8	6989	6996	0 %	0 %	75 %	25 %	125654701
150	NC_009008	TGA	2	6	7034	7039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654701
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153	NC_009008	GC	3	6	7360	7365	0 %	0 %	50 %	50 %	125654702
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156	NC_009008	TGC	2	6	7480	7485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654702
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164	NC_009008	GGGA	2	8	7870	7877	25 %	0 %	75 %	0 %	125654702
165	NC_009008	TC	3	6	7915	7920	0 %	50 %	0 %	50 %	125654702
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167	NC_009008	CGG	2	6	7987	7992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654702
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169	NC_009008	GCTTG	2	10	8034	8043	0 %	40 %	40 %	20 %	125654702
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183	NC_009008	GTGCT	2	10	9149	9158	0 %	40 %	40 %	20 %	125654704
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253	NC_009008	AGGCC	2	10	14129	14138	20 %	0 %	40 %	40 %	125654708
254	NC_009008	AGC	2	6	14139	14144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654708
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256	NC_009008	GCC	2	6	14202	14207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654708
257	NC_009008	CGA	2	6	14260	14265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654708
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259	NC_009008	GCG	2	6	14364	14369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654708
260	NC_009008	TCG	2	6	14376	14381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654708
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262	NC_009008	CAG	2	6	14453	14458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654708
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264	NC_009008	GCCC	2	8	14524	14531	0 %	0 %	25 %	75 %	125654708
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392	NC_009008	GCC	2	6	20064	20069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654711
393	NC_009008	CCG	2	6	20104	20109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654711
394	NC_009008	CGC	3	9	20119	20127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654711
395	NC_009008	CGC	2	6	20145	20150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654711
396	NC_009008	GC	4	8	20201	20208	0 %	0 %	50 %	50 %	125654711
397	NC_009008	GGC	2	6	20241	20246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654711
398	NC_009008	TCC	2	6	20260	20265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125654711
399	NC_009008	GC	3	6	20297	20302	0 %	0 %	50 %	50 %	125654711
400	NC_009008	CG	3	6	20337	20342	0 %	0 %	50 %	50 %	125654711
401	NC_009008	TCGG	2	8	20350	20357	0 %	25 %	50 %	25 %	125654711
402	NC_009008	GCG	4	12	20388	20399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654712
403	NC_009008	GGC	2	6	20402	20407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654712
404	NC_009008	CG	3	6	20435	20440	0 %	0 %	50 %	50 %	125654712
405	NC_009008	TCT	2	6	20518	20523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125654712
406	NC_009008	GATC	2	8	20545	20552	25 %	25 %	25 %	25 %	125654712
407	NC_009008	CCG	2	6	20587	20592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125654712
408	NC_009008	TCG	2	6	20610	20615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125654712
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410	NC_009008	CAG	2	6	20633	20638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125654712
411	NC_009008	CG	3	6	20657	20662	0 %	0 %	50 %	50 %	125654712
412	NC_009008	GC	4	8	20684	20691	0 %	0 %	50 %	50 %	125654712
413	NC_009008	CG	3	6	20775	20780	0 %	0 %	50 %	50 %	125654712
414	NC_009008	CGG	2	6	20799	20804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654712
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422	NC_009008	GC	3	6	21455	21460	0 %	0 %	50 %	50 %	125654713
423	NC_009008	CAC	2	6	21489	21494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125654713
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427	NC_009008	CCGAG	2	10	21602	21611	20 %	0 %	40 %	40 %	125654713
428	NC_009008	GCG	2	6	21634	21639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654713
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431	NC_009008	GCCC	2	8	21734	21741	0 %	0 %	25 %	75 %	125654713
432	NC_009008	GGC	2	6	21828	21833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654713
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462	NC_009008	GCG	2	6	23528	23533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125654715
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493	NC_009008	CCGCG	2	10	26495	26504	0 %	0 %	40 %	60 %	125654718
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499	NC_009008	TGA	2	6	26744	26749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125654718
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